home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir31 / melsc.zip / STARFISH.DNA < prev    next >
Text File  |  1991-11-27  |  9KB  |  255 lines
  1. LOCUS       PIOACT       5070 bp ds-DNA             INV       15-DEC-1989
  2. DEFINITION  Starfish (P.ochraceus) muscle actin gene, complete cds.
  3. ACCESSION   M26500
  4. KEYWORDS    actin.
  5. SOURCE      Starfish (P.ochraceus) DNA, clone-lambda PoA160.
  6.   ORGANISM  Pisaster ochraceus
  7.             Eukaryota; Animalia; Eumetazoa; Echinodermata; Asterozoa;
  8.             Stelleroidea; Asteroidea; Forcipulata; Asteriidae.
  9. REFERENCE   1  (bases 1 to 5070)
  10.   AUTHORS   Kowbel,D.J. and Smith,M.J.
  11.   TITLE     The genomic nucleotide sequences of two differentially expressed
  12.             actin-coding genes from the sea star Pisaster ochraceus
  13.   JOURNAL   Gene 77, 297-308 (1989)
  14.   STANDARD  simple staff_entry
  15. COMMENT     Draft entry and computer readable copy of sequence [Gene 77,
  16.             297-308 (1989)] kindly
  17.             provided by D.J.Kowbel, 25-JUL-1989.
  18. FEATURES             Location/Qualifiers
  19.      CDS             join(866. .991,1689. .1928,2414. .2498,2849. .3010,3284.
  20.  .3475,
  21.                      4064. .4389)
  22.                      /note="muscle actin"
  23.                      /codon_start=866
  24.      exon            866. .991
  25.                      /note="muscle actin, exon 1"
  26.      intron          992. .1688
  27.                      /note="M actin intron A"
  28.      exon            1689. .1928
  29.                      /note="muscle actin, exon 2"
  30.      intron          1929. .2413
  31.                      /note="M actin intron B"
  32.      exon            2414. .2498
  33.                      /note="muscle actin, exon 3"
  34.      intron          2499. .2848
  35.                      /note="M actin intron C"
  36.      exon            2849. .3010
  37.                      /note="muscle actin, exon 4"
  38.      intron          3011. .3283
  39.                      /note="M actin intron D"
  40.      exon            3284. .3475
  41.                      /note="muscle actin, exon 5"
  42.      intron          3476. .4063
  43.                      /note="M actin intron E"
  44.      exon            4064. .4389
  45.                      /note="muscle actin, exon 6"
  46. BASE COUNT     1471 a   1070 c   1028 g   1500 t      1 others
  47. ORIGIN      1 bp upstream of Hind III site.
  48.  
  49. M26500  Length: 5070  November 27, 1991  01:25  Type: N  Check: 6675  ..
  50.  
  51.        1  AAGCTTGATG TTTTCATTTG TGCGCCATGT TGTCATTTTC ACTTTTCAGA 
  52.  
  53.       51  TTTTACAGTC AGACCAAATA CTGTCAGTGC TCTTCAGTTA TTTCTGCAGT 
  54.  
  55.      101  ATTTTCAGAG GCCATTTTAA AACAGAGAAA GTGTGTGTCC CATAAGCATG 
  56.  
  57.      151  CCCATCTGTA TAATGAGCAT TCCTATAATG ACCGCCTAAT TTGGAAATCC 
  58.  
  59.      201  AGAAGCTGAA ACCTTCAACC AATCGCGAGA ACTGTTATGT CGTTAAGCCA 
  60.  
  61.      251  ACGGACCAAT TAGAGCGCTC GATCTTCTGG TATTTTGACC GCATTCGTCT 
  62.  
  63.      301  CCACTCCAAA CAAGGTCATG GTGAATACAT GCGCTGATGT GGAATGTAGC 
  64.  
  65.      351  CGACTATGCC GAAGTGTGTG TTACACATTA CACTTATTAT TTTTATGGGT 
  66.  
  67.      401  TAGACATGCA AAGTTGATAA AGACCTAAAA CGTGTGAGAA AAAAAAAATG 
  68.  
  69.      451  GGGATCTAAC TGGGGTTTAT TTTCGGTGGT GCTAATACAA TCGCAGGAAA 
  70.  
  71.      501  TGCCGCTTCG TGCTGTTATG TTGTTGAGAC AGTTAGTAAT GTAAAAAGGA 
  72.  
  73.      551  TTTGGATGTC AAACACAGAT AAGCATTTTA TTTGACACAA TTTCGCAGTT 
  74.  
  75.      601  TGTATTTATT TATTTGTTCA ATAATTTTTT TTTCAGAATT GGATTTGAAC 
  76.  
  77.      651  TCTTTCCATC AATTTGACAT TTAGGGAGAG AGATAAGAAT TTAAACGGAC 
  78.  
  79.      701  AGGAAAGTTA TCGTGCAGCT CTCAGCTTTT CCAGGAATGA ATTTCGCCTC 
  80.  
  81.      751  TCGATCGCCT CAATCTAAAC AATTTTGTAT ACTATCTCAA GTTGGTGTAT 
  82.  
  83.      801  TTTGTTTACT TTTACCACTT TTCCAGGATT TGTTTGACGT GAAGGGAACT 
  84.  
  85.      851  AGGTAATCAT TCACCATGTG TGACGAGGAT GTTGCCGCTT TGGTCGTAGA 
  86.  
  87.      901  CAATGGCTCC GGTATGTGCA AGGCCGGATT CGCCGGAGAC GATGCCCCAA 
  88.  
  89.      951  GGGCTGTGTT CCCATCCATT GTAGGGAGAC CACGTCACCA GGTTTGTGAA 
  90.  
  91.     1001  ATTTGTCTAC TGTTCCCATG CATTTAAGGG AGAAACGTCA ACATATTCCT 
  92.  
  93.     1051  ATTAATTGCC ACCTCAACGA AAGTCAAACA AAAAGACTGT AACTCACCAT 
  94.  
  95.     1101  CATGCATGCA CTCTTCTCTG TGTTTTCCCT GGCAACAAGA CTGGAAGAAA 
  96.  
  97.     1151  CTGTGAAACA TGTGACATTG AGTATCAAAG CAACGTGACA TTTTCGTCAT 
  98.  
  99.     1201  CAAATTTCCC ATTTGGTCAG TCTACACTAC CTGCAACTCT TTGCACAACA 
  100.  
  101.     1251  TGGAGCATGA TTACAAAAAA TGCCAATTCA ACAATGTACT GGGTTGAGGG 
  102.  
  103.     1301  TGAACCAACC GTTTCATAAG ACAGCCCCCA TTTGCCATGC CAGATGTGTG 
  104.  
  105.     1351  GCAGAGGGAG TCTCCCAACA AAAATGTTCA TAGGCCTACA CTGTACCACA 
  106.  
  107.     1401  ATCTTGTAAG GAAGTTCAGC CGAAATCATC TAAAGGATTC CTGAGATTCC 
  108.  
  109.     1451  CAGAACACAA TGGGGGCGGG GGGGGGGTAG ACCATAACTC ACTGAGCACC 
  110.  
  111.     1501  AAATGTCGCA CCGGATTGTA AGATGTCTTA ATCCGGATGG CCGGGTTAAT 
  112.  
  113.     1551  TGTTCAAAAT AACAAGAACA CAGGAGCAAG ACTATTTTGA ATAGTACTAC 
  114.  
  115.     1601  AAAACCTCAA ACCAAACCAA GCCAAACAAA TACTTCTTCA TGAAACTTTG 
  116.  
  117.     1651  ATTCATGACT AGAATTTGAT TTGTCTTTAT CCATATAGGG TGTGATGGTA 
  118.  
  119.     1701  GGTATGGGTC AGAAGGACAG CTACGTAGGA GACGAAGCCC AGAGCAAGAG 
  120.  
  121.     1751  AGGTATCCTG ACTCTCAAGT ACCCCATTGA GCACGGTATC GTCACTAACT 
  122.  
  123.     1801  GGGACGATAT GGAGAAGATC TGGCATCACA CCTTCTACAA TGAACTCCGT 
  124.  
  125.     1851  GTGGCACCAG AGGAGCACCC CGTGCTCTTG ACTGAAGCCC CCCTCAACCC 
  126.  
  127.     1901  CAAAGCCAAC AGAGAAAAGA TGACACAGGT ATGATAATGC TGGTTTGTTT 
  128.  
  129.     1951  GTTTGTTTGT TTGTTGAGTC GTTGGGGTGT TGGGGTGTTT ATTTGTTTGT 
  130.  
  131.     2001  TTGTTTATTT GTTTTTTGGG GGGCGGTTGA TATAAGGAGG CATTCTTTGT 
  132.  
  133.     2051  CCTTTACACC TCAGTTTGAT TTTAATACAC TGACACGAGT TTGATACAAA 
  134.  
  135.     2101  ATGGCCGCAG CATGATTACG GCCCTTTGGC GATAACAGTT GGATCGAGCA 
  136.  
  137.     2151  GATGTTAAAG AACAGCTCTT ACAAAATTAT ACGTATTTTG TCAAGAATAT 
  138.  
  139.     2201  TGTTTGAAGA ATTGCATTTT ATTTCCACTC ACTATAAGAA GGGCATGTAT 
  140.  
  141.     2251  CCATTATGCC GTTGTAAATT CACTTTTTGT GGGGGATCAA GCGTGATCTC 
  142.  
  143.     2301  TCTTCTAAGA AAGTGAACAT TCAGAAGATC TTGTATTCTT TCACCTAAAC 
  144.  
  145.     2351  GCCACACAAA TCTTTTAGGA AATAAGATAA CAATCTGGTG TTATTATTGC 
  146.  
  147.     2401  TCTCTCCAAA CAGATCATGT TCGAGACCTT CAACTCCCCC GCCATGTACG 
  148.  
  149.     2451  TCGCCATCCA GGCTGTGCTC TCCCTCTACG CTTCCGGTCG TACCACCGGT 
  150.  
  151.     2501  AAATATTCTC TTCTACTTTT CTAAAGAAAA ATTAAAATAA ACAACAACTG 
  152.  
  153.     2551  AAAAAATGGT GTAACGTTTG TGCTTGATGG GGGGAAAAAA CCACACACAC 
  154.  
  155.     2601  AAATACACAC AGACGATCGT TACTCTCAAA GTTTCATTTC CATAAATTGG 
  156.  
  157.     2651  AGAAATTCTA GCTCCGAAGG CGACACTTCA TCGTTAGTTG GTTCGTTCGT 
  158.  
  159.     2701  ATTTTGAAAG TGCGTATAAA ACCAACTTAT AAACTATCTT CTTTTAAAAT 
  160.  
  161.     2751  GATCCTCTTG GTTCAATGCA GTTTGATTGA AATAATCTTC CTCGAAACAT 
  162.  
  163.     2801  TACAGTCATG CCAAGACTTT AAGTACATCT TAAAAATCTT CTCTGCAGGT 
  164.  
  165.     2851  ATTGTCTTCG ATACCGGCGA TGGTGTCTCC CACACCGTCC CAATCTACGA 
  166.  
  167.     2901  AGGTTACGCT CTCCCCCACG CCATCCTCCG TCTGGACTTG GCTGGTCGTG 
  168.  
  169.     2951  ACTTGACCGA CTACTTGATG AAGATCCTTA CCGAGCGTGG CTACTCTTTC 
  170.  
  171.     3001  ACAACCACGG GTAGGTTTGT CTGTTTGTTC GTAATGTACA CTTTTTATAA 
  172.  
  173.     3051  AAACAAACTT TTAGTGCAAC AAGTAGAAGT CGACGTGAAA AGTTAACGAG 
  174.  
  175.     3101  AAAGTCTTCC AAACTTGTCC CGTTCCTCTT CTGTTTTTAG TTGTTTATGT 
  176.  
  177.     3151  TGGATTGCCC CAATTAAATG GAAATTACAT TATGGCTTGT ATAAGTCTTC 
  178.  
  179.     3201  AATACACCTC ACCCATTCGT CTAGGCTTTT TGACAATTTC TGTACAAACA 
  180.  
  181.     3251  ATTGAAAACG CTCTCTTTAT TTTCCCCCTA AAGCCGAGCG TGAAATCGTG 
  182.  
  183.     3301  CGTGACATCA AGGAGAAACT TTGCTACACC GCCTTGGACT TCGAGCAGGA 
  184.  
  185.     3351  GATGCAGACC GCTTCATCCA GCTCCTCCTT GGAGAAGAGC TACGAGTTGC 
  186.  
  187.     3401  CCGACGGTCA GGTCATCACC ATCGGAAACG AGCGCTTCAG GTGCCCCGAG 
  188.  
  189.     3451  ACCCTCTTCC AGCCCGCTTT CATTGGTAAG AGAAGCTGCC CCCCCCCATG 
  190.  
  191.     3501  ATCCTTCTAT TTTCTATCAA TATCGTGGAA GTTGTAGTTT TACAATAAAG 
  192.  
  193.     3551  TTCCCACAAA AAGAAATATC AGATTAAGAG AAAATGTATG CTTTTCTGTT 
  194.  
  195.     3601  CAACTCTATA TCTCGTGGAA AAACAGAACA CAAACAAATC ATATACAGGA 
  196.  
  197.     3651  TGATTACAGC TTGACCCTGA GTGGGCATAA TGTGTTGTCT TTTAGATGGG 
  198.  
  199.     3701  AGCTGTAGGG CCCGTGTACA CTAGGCCTAT GATTGGTAGT GCACACACAA 
  200.  
  201.     3751  TGACCCAGAA CACTTAGCGT GGAAGAGTTA ATGCCGGTGT TTCTGGTTCA 
  202.  
  203.     3801  CATATACCAA GCACGCTTGT TAACAGGTTC TCTCTGGCTT GCTATATCTG 
  204.  
  205.     3851  CAGTGATTGC TTTCGCTTAA TATCAGACAT TCTTGGTTTC AATAATACTA 
  206.  
  207.     3901  GAAATATGTA TAAAATATAA TAAGTATACG GATTTCATTG GATCTGATGC 
  208.  
  209.     3951  TTTGCATTGT TGGGTTTTAA AAGTAGAAGT ACCGGCCCTT AGACGACCCG 
  210.  
  211.     4001  AAAACAAAGT TATTGAGAAG TTGTGTTTAC TATTGTGGTG CTTTCTCTAT 
  212.  
  213.     4051  TCTCGGTACC CAGGTATGGA ATCTGCCGGT ATCCACGAAA CTACCTACAA 
  214.  
  215.     4101  CAGCATCATG AAGTGCGACA TTGATATCCG TAAGGATCTG TACGCCAACA 
  216.  
  217.     4151  CCGTCCTCTC CGGAGGTACC AGCATGTACC CAGGTATCGC TGACCGTATG 
  218.  
  219.     4201  CAGAAGGAAA TCCAGGCCCT CGCTCCACCC ACGATGAAGA TCAAGATCAT 
  220.  
  221.     4251  CGCTCCCCCA GAGAGAAAGT ACTCCGTATG GATCGGTGGC TCCATCCTTG 
  222.  
  223.     4301  CCTCTCTGTC CACCTTCCAA CAGATGTGGA TCAGCAAGCA GGAATACGAC 
  224.  
  225.     4351  GAGTCTGGCC CCAGCATCGT CCACCGCAAA TGCTTCTAAA CTGTTTGCTG 
  226.  
  227.     4401  GAAATATTCA GACTGTATTT TTTTTTCAAT TATTGTGCAT TTTATTGTGC 
  228.  
  229.     4451  ATTTTTTTTG TTTCATCACC AGCGTTGACA TGGAAACCGA ATGAGTTCAC 
  230.  
  231.     4501  CATGGATTAT TATTAATATT ATTTATTTGT TCTCAGATTC TACTAATTTC 
  232.  
  233.     4551  AAAACAGTGC AATTGTGGTC AAACTGAATG AAGTTGTCAC AGCAGGCCAA 
  234.  
  235.     4601  CCATGTGCAA AAGAAGAAAA AAAAAAAAAA CTACGATACT CTCAGCCTTG 
  236.  
  237.     4651  AGTCATTCAA ACTGAAATTA TTCCCTTTTT TGGAGTCGCC GTTTTTATTT 
  238.  
  239.     4701  AGGTCTTTGT TTTGCAAAAA AGTAAGAACT GGCTTCGGTC TAATGAGAGA 
  240.  
  241.     4751  AGTTAATTCA CTGATTGTCT TGAGTGCCTT TGATGGATTG GCCGTAAAAA 
  242.  
  243.     4801  ATCTTGAAGT AAGACCAAGC GAGCAAACTA AGATGACTTT TTTTCCCCCT 
  244.  
  245.     4851  TTGCTGNACC AAATAAAACA GCTTCAACAG CAACAACAAA ATCTCGAAAA 
  246.  
  247.     4901  AAACCAAACT AGAAAAAATA AAAGGTAGAG CTAGATTTAT GATAGAAATA 
  248.  
  249.     4951  GAGACATTGT AAAAGCGAAA GTTGAATGGG CTGATCGATC TATATTGTTC 
  250.  
  251.     5001  AAATCAGATA CATTTTTATT CTGGTCCGTG CGACTTACGA TAGAGGGCGG 
  252.  
  253.     5051  GACACAAGTT GCAATATCAT 
  254.  
  255.